《南京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報》（雙月刊）創(chuàng)刊于1959年創(chuàng)刊，是由南京中醫(yī)藥大學(xué)主辦的全國有影響的綜合性中醫(yī)藥學(xué)術(shù)刊物。
《南京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報》設(shè)有學(xué)術(shù)探討、臨床研究、方藥研究、針灸推拿、醫(yī)史文獻臨床報道、經(jīng)驗交流等專欄。
《南京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報》是國際標(biāo)準(zhǔn)連續(xù)出版物，被北大2008版核心期刊收錄。
《南京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報》（社會科學(xué)版）（季刊）創(chuàng)刊于1999年，本刊是經(jīng)國家新聞出版署批準(zhǔn)、由江蘇省教育廳主管、南京中醫(yī)藥大學(xué)主辦的學(xué)術(shù)性季刊，國內(nèi)外公開發(fā)行，國際標(biāo)準(zhǔn)大16開本，每期64頁，逢季中月18日出版。
《南京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報》（社會科學(xué)版）刊登中醫(yī)文化、哲學(xué)、經(jīng)濟、中醫(yī)學(xué)史、中醫(yī)文獻、醫(yī)學(xué)心理、醫(yī)學(xué)倫理、中醫(yī)海內(nèi)外教育等方面的學(xué)術(shù)論文。讀者對象為高等中醫(yī)藥院校、科研單位的教學(xué)、科研人員，以及廣大傳統(tǒng)文化、中醫(yī)藥學(xué)的愛好者。
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